南京城墙博物馆是一座国家一级博物馆，国内规模最大的城墙专题博物馆，基本陈列围绕“旷世城垣”主题，从设计思想、筑城技术、皇都威仪、军事防御、遗产传承五个方面展示南京城墙的历史与文化。
南京大报恩寺遗址博物馆位于南京市秦淮河畔、明城墙边，坐落于城市发源地长干里，是在明代大报恩寺考古遗址之上原址新建而成的。该博物馆自2015年正式对外开放以来，已累计接待观众超过630万人次。
六朝博物馆馆藏资源丰富，展出青瓷器、陶俑、墓志、建筑构件、石刻、书画等大量珍贵文物，以及六朝建康城城墙和大型排水设施遗迹。这些藏品生动地再现了六朝时期的社会风貌和艺术特质。
南京中国科举博物馆位于江苏省南京市秦淮区夫子庙学宫东侧，是中国科举制度中心、科举文化中心和科举文物收藏中心。该馆前身为江南贡院，是中国历史上规模最大、影响最深远的科举考场，也是科举制度的有形遗产在南京的直观体现。
